Ο διαχειριστής της επιχείρησής, ο οποίος ορίζεται κατά την εγγραφή στο payzy pro, έχει την πλήρη αρμοδιότητα και δυνατότητα να διαχειριστεί τον payzy pro λογαριασμό κάθε φυσικού καταστήματος της επιχείρησής.
Με αυτό τον τρόπο εξασφαλίζεται ότι όλες οι συναλλαγές και οι λογαριασμοί των καταστημάτων θα παραμένουν υπό τον απόλυτο έλεγχο και την εποπτεία του διαχειριστή.
Σε περίπτωση που έχει δοθεί άδεια για επιπλέον τερματικό QR, ο χρήστης της άδειας έχει μόνο τη δυνατότητα να λαμβάνει συναλλαγές QR. Σε περίπτωση επιστροφής χρημάτων για πληρωμές QR, απαιτείται η άδεια του διαχειριστή, η οποία θα ζητείται μέσω push notification.